Ogólna charakterystyka
| Typ |
Klaster na procesorach Itanium 2 |
| Nazwa |
holk |
| Adres IP |
192.168.x.x |
| Procesory |
Intel Itanium II 1.3 GHz, 3 MB Cache L3, architektura EPIC, liczba procesorów: 256 |
| Pamięć operacyjna |
640 GB |
| Pamięć dyskowa |
5.7 TB |
| Architektura |
klaster maszyn SMP z siecią Gigabit Ethernet/InfiniBand |
| Sieć |
po 2 porty Gigabit Ethernet na nodzie, switche D-Link |
| System operacyjny |
Debian GNU/Linux, wersja 3.0 |
| Lokalizacja |
Trójmiejska Akademicka Sieć Komputerowa - Gdańsk |
Opis
Klaster zbudowany jest z modułów w architekturze SMP. Każdy moduł zawiera po dwa procesory Itanium2, 2 GB pamięci operacyjnej, 36 GB dysk twardy SCSI, oraz dwa porty Gigabit Ethernet. Aktualnie moduły są podłączone za pomocą pojedyńczego łącza do switchy gigabitowych firmy D-Link.
Moduły pracują po kontrolą systemu operacyjnego Debian GNU/Linux 3.0. Do komunikacji wykorzystywana są biblioteki MPICH i LAM.
Klaster jest wykorzystywany głównie do symulacji dużych biomolekuł i fazy skondensowanej na poziomie dynamiki molekularnej oraz kwantowomechanicznym.
W sierpniu 2004 pamięć operacyjna klastra została zwiększona poprzez dołożenie do połowy nodów 4 GB pamięci
Od listopda 2004 w skład klastra holk wchodzi podklaster clusterix złozóny z 16 węzłów wyposażonych w 2 procesory Itanium2 1.4 GHz oraz sieć InfiniBand. Tabela pokazuje parametry zbiorcze całego klastra.
Teoretyczna moc obliczeniowa klastra wynosi 1510 GFlop/s
Zainstalowane oprogramowanie użytkowe
amber, gamess, gaussian
Holk został sklasyfikowany na 231 miejscu listy TOP500 (listopad 2003)